Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VLDLRP98155 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VLDLRP98155 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VLDLRP98155 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VLDLRP98155 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VLDLRP98155 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms