Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKOR1P84550 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKOR1P84550 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKOR1P84550 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms