Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX1P83916 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX1P83916 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX1P83916 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX1P83916 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX1P83916 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX1P83916 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX1P83916 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX1P83916 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX1P83916 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX1P83916 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX1P83916 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX1P83916 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX1P83916 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms