Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX1P78414 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX1P78414 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX1P78414 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRX1P78414 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX1P78414 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX1P78414 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX1P78414 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX1P78414 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRX1P78414 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRX1P78414 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRX1P78414 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRX1P78414 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRX1P78414 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRX1P78414 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRX1P78414 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRX1P78414 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRX1P78414 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRX1P78414 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRX1P78414 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms