Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBB4BP68371 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB4BP68371 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms