Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVFC1P60507 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERVFC1P60507 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERVFC1P60507 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms