Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RWDD2BP57060 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RWDD2BP57060 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms