Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN8P56748 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms