Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms