Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHBP55084 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHBP55084 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHBP55084 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHBP55084 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHBP55084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHBP55084 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHBP55084 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHBP55084 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHBP55084 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHBP55084 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHBP55084 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHBP55084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHBP55084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHBP55084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHBP55084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHBP55084 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHBP55084 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms