Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLTPP55058 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLTPP55058 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLTPP55058 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLTPP55058 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLTPP55058 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLTPP55058 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLTPP55058 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLTPP55058 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLTPP55058 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms