Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms