Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB4P54760 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB4P54760 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms