Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGGT1BP53609 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP53609 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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