Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACLYP53396 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACLYP53396 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACLYP53396 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACLYP53396 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACLYP53396 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACLYP53396 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACLYP53396 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACLYP53396 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms