Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK3P51956 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEK3P51956 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEK3P51956 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEK3P51956 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK3P51956 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEK3P51956 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEK3P51956 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms