Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCA2P51587 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms