Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAMP50895 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAMP50895 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAMP50895 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAMP50895 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAMP50895 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCAMP50895 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCAMP50895 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAMP50895 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAMP50895 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAMP50895 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAMP50895 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAMP50895 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAMP50895 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAMP50895 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAMP50895 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAMP50895 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAMP50895 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAMP50895 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCAMP50895 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCAMP50895 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCAMP50895 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAMP50895 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAMP50895 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAMP50895 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAMP50895 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAMP50895 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAMP50895 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAMP50895 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAMP50895 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAMP50895 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAMP50895 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms