Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPOXP50336 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPOXP50336 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPOXP50336 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPOXP50336 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PPOXP50336 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PPOXP50336 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms