Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN2P49810 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms