Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP4P49662 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP4P49662 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP4P49662 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP4P49662 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP4P49662 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP4P49662 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP4P49662 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP4P49662 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP4P49662 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP4P49662 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms