Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNC1P48547 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms