Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RXRGP48443 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RXRGP48443 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RXRGP48443 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RXRGP48443 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RXRGP48443 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms