Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIP4K2AP48426 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIP4K2AP48426 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PIP4K2AP48426 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms