Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TM4SF4P48230 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TM4SF4P48230 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF4P48230 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms