Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA1P46926 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms