Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MMP13P45452 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP13P45452 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP13P45452 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP13P45452 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP13P45452 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP13P45452 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP13P45452 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP13P45452 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP13P45452 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP13P45452 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms