Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-1P43699 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NKX2-1P43699 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms