Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYKP43405 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYKP43405 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYKP43405 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYKP43405 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYKP43405 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYKP43405 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYKP43405 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SYKP43405 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYKP43405 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYKP43405 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYKP43405 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYKP43405 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYKP43405 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYKP43405 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYKP43405 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYKP43405 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms