Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSKP43235 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSKP43235 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSKP43235 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSKP43235 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSKP43235 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSKP43235 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSKP43235 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTSKP43235 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSKP43235 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSKP43235 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSKP43235 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSKP43235 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSKP43235 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSKP43235 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms