Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2IP36954 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2IP36954 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms