Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBRP36941 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBRP36941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBRP36941 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBRP36941 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBRP36941 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBRP36941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBRP36941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LTBRP36941 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBRP36941 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBRP36941 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBRP36941 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBRP36941 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBRP36941 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms