Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TGFBR1P36897 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms