Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN7P35236 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN7P35236 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms