Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA4P35212 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA4P35212 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA4P35212 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA4P35212 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA4P35212 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA4P35212 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA4P35212 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA4P35212 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA4P35212 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA4P35212 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA4P35212 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms