Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX1P32242 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX1P32242 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX1P32242 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OTX1P32242 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OTX1P32242 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms