Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TSPOP30536 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSPOP30536 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSPOP30536 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSPOP30536 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms