Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRMP28827 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms