Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGB2P26583 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGB2P26583 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms