Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMLP26374 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHMLP26374 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHMLP26374 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHMLP26374 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMLP26374 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMLP26374 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMLP26374 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMLP26374 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMLP26374 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMLP26374 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMLP26374 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMLP26374 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMLP26374 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMLP26374 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMLP26374 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms