Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP5F1P24539 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5F1P24539 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms