Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms