Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGFR3P22607 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGFR3P22607 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms