Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A1P19634 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms