Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD58P19256 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD58P19256 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD58P19256 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD58P19256 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD58P19256 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD58P19256 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD58P19256 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD58P19256 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD58P19256 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD58P19256 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD58P19256 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD58P19256 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD58P19256 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD58P19256 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD58P19256 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD58P19256 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD58P19256 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD58P19256 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD58P19256 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD58P19256 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD58P19256 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD58P19256 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD58P19256 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD58P19256 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms