Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIG1P18858 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIG1P18858 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIG1P18858 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIG1P18858 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIG1P18858 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIG1P18858 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIG1P18858 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIG1P18858 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIG1P18858 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG1P18858 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG1P18858 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG1P18858 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG1P18858 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIG1P18858 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIG1P18858 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIG1P18858 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG1P18858 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG1P18858 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG1P18858 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG1P18858 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG1P18858 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIG1P18858 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIG1P18858 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIG1P18858 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIG1P18858 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms