Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF7P17544 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF7P17544 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF7P17544 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF7P17544 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7P17544 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7P17544 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7P17544 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7P17544 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7P17544 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF7P17544 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7P17544 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF7P17544 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF7P17544 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF7P17544 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms