Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD1P17405 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms