Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDGFRAP16234 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDGFRAP16234 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms