Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFAP15692 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFAP15692 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms